MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 39160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009033	A	6	6	68	73	100 %	0 %	0 %	0 %	126464914
2	NC_009033	GTT	2	6	152	157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464914
3	NC_009033	TCT	2	6	187	192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464914
4	NC_009033	TA	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	126464914
5	NC_009033	TGGA	2	8	226	233	25 %	25 %	50 %	0 %	126464914
6	NC_009033	TGA	2	6	253	258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464914
7	NC_009033	GGA	2	6	266	271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464914
8	NC_009033	AAG	2	6	287	292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464914
9	NC_009033	GA	4	8	391	398	50 %	0 %	50 %	0 %	126464914
10	NC_009033	TTA	2	6	449	454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464914
11	NC_009033	GAT	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464914
12	NC_009033	ATA	2	6	539	544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464914
13	NC_009033	AAT	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464914
14	NC_009033	GAAA	2	8	646	653	75 %	0 %	25 %	0 %	126464914
15	NC_009033	AAT	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464914
16	NC_009033	GATG	2	8	726	733	25 %	25 %	50 %	0 %	126464914
17	NC_009033	TCT	2	6	787	792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464914
18	NC_009033	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464914
19	NC_009033	CTG	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464914
20	NC_009033	AAT	2	6	808	813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464914
21	NC_009033	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464914
22	NC_009033	GA	3	6	950	955	50 %	0 %	50 %	0 %	126464914
23	NC_009033	TTG	2	6	960	965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464914
24	NC_009033	AAG	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464914
25	NC_009033	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464914
26	NC_009033	A	6	6	986	991	100 %	0 %	0 %	0 %	126464914
27	NC_009033	TAT	2	6	1093	1098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464915
28	NC_009033	AAT	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464915
29	NC_009033	TAA	2	6	1179	1184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464915
30	NC_009033	AGC	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464915
31	NC_009033	GCC	2	6	1208	1213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464915
32	NC_009033	GGA	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464915
33	NC_009033	GGA	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464915
34	NC_009033	TGGC	2	8	1272	1279	0 %	25 %	50 %	25 %	126464915
35	NC_009033	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464915
36	NC_009033	ATG	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464915
37	NC_009033	ACT	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464915
38	NC_009033	CTA	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464915
39	NC_009033	GTT	2	6	1436	1441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464915
40	NC_009033	GAA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464915
41	NC_009033	ATT	2	6	1483	1488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464915
42	NC_009033	G	6	6	1489	1494	0 %	0 %	100 %	0 %	126464915
43	NC_009033	TC	3	6	1543	1548	0 %	50 %	0 %	50 %	126464915
44	NC_009033	ATTA	2	8	1570	1577	50 %	50 %	0 %	0 %	126464915
45	NC_009033	AAT	2	6	1627	1632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464915
46	NC_009033	TAT	2	6	1644	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464915
47	NC_009033	GAT	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464916
48	NC_009033	TAA	3	9	1731	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464916
49	NC_009033	ATA	2	6	1745	1750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464916
50	NC_009033	GCT	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464916
51	NC_009033	A	6	6	1848	1853	100 %	0 %	0 %	0 %	126464916
52	NC_009033	TTC	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464916
53	NC_009033	GGA	2	6	1982	1987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464916
54	NC_009033	GAA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464916
55	NC_009033	TA	3	6	2002	2007	50 %	50 %	0 %	0 %	126464917
56	NC_009033	T	6	6	2013	2018	0 %	100 %	0 %	0 %	126464917
57	NC_009033	GAA	2	6	2020	2025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464917
58	NC_009033	ATTA	2	8	2031	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	126464917
59	NC_009033	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464917
60	NC_009033	ATA	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464917
61	NC_009033	TAGAA	2	10	2217	2226	60 %	20 %	20 %	0 %	126464917
62	NC_009033	TAG	2	6	2249	2254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464917
63	NC_009033	ACT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464917
64	NC_009033	AT	3	6	2335	2340	50 %	50 %	0 %	0 %	126464917
65	NC_009033	TGT	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464917
66	NC_009033	AT	3	6	2469	2474	50 %	50 %	0 %	0 %	126464917
67	NC_009033	AAC	2	6	2481	2486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464917
68	NC_009033	A	6	6	2553	2558	100 %	0 %	0 %	0 %	126464917
69	NC_009033	AT	3	6	2570	2575	50 %	50 %	0 %	0 %	126464917
70	NC_009033	ATTC	2	8	2611	2618	25 %	50 %	0 %	25 %	126464917
71	NC_009033	TTC	2	6	2719	2724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464917
72	NC_009033	TTA	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464917
73	NC_009033	AT	3	6	2870	2875	50 %	50 %	0 %	0 %	126464918
74	NC_009033	CTC	3	9	2912	2920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464918
75	NC_009033	ATA	2	6	2921	2926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464918
76	NC_009033	ACA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464918
77	NC_009033	ATT	3	9	3016	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464918
78	NC_009033	ATG	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464918
79	NC_009033	TGA	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464918
80	NC_009033	TAA	2	6	3169	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464918
81	NC_009033	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	126464918
82	NC_009033	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	126464918
83	NC_009033	GCT	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464918
84	NC_009033	CGA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464918
85	NC_009033	GAA	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464918
86	NC_009033	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464918
87	NC_009033	CT	3	6	3461	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009033	TAA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009033	GAA	2	6	3516	3521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464919
90	NC_009033	AT	3	6	3538	3543	50 %	50 %	0 %	0 %	126464919
91	NC_009033	GGA	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464919
92	NC_009033	ATT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464919
93	NC_009033	TTG	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464919
94	NC_009033	TGA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464919
95	NC_009033	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464919
96	NC_009033	TAA	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464919
97	NC_009033	CTT	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464920
98	NC_009033	TGC	2	6	4018	4023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464920
99	NC_009033	AT	3	6	4036	4041	50 %	50 %	0 %	0 %	126464920
100	NC_009033	TTC	2	6	4049	4054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464920
101	NC_009033	AAT	2	6	4082	4087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464920
102	NC_009033	AT	3	6	4183	4188	50 %	50 %	0 %	0 %	126464920
103	NC_009033	TAC	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464920
104	NC_009033	CTTC	2	8	4287	4294	0 %	50 %	0 %	50 %	126464920
105	NC_009033	TTA	2	6	4295	4300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464920
106	NC_009033	AAT	2	6	4325	4330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464920
107	NC_009033	TCA	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464920
108	NC_009033	CTT	2	6	4399	4404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464920
109	NC_009033	GCT	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464920
110	NC_009033	AAT	2	6	4474	4479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464920
111	NC_009033	TCA	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464920
112	NC_009033	ATT	3	9	4535	4543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464920
113	NC_009033	TCA	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464920
114	NC_009033	GCC	2	6	4693	4698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464920
115	NC_009033	TAA	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464920
116	NC_009033	CAA	2	6	4785	4790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464920
117	NC_009033	CAA	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464920
118	NC_009033	CAT	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464920
119	NC_009033	ATT	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009033	TAG	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009033	TAT	2	6	4903	4908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009033	TAA	2	6	4920	4925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009033	AAT	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009033	AGG	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009033	ATG	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009033	TAA	2	6	5123	5128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009033	A	6	6	5139	5144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009033	TTTC	2	8	5171	5178	0 %	75 %	0 %	25 %	126464921
129	NC_009033	CAT	2	6	5286	5291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464921
130	NC_009033	TTC	2	6	5337	5342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464921
131	NC_009033	TGA	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464921
132	NC_009033	TAG	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464921
133	NC_009033	AT	3	6	5444	5449	50 %	50 %	0 %	0 %	126464921
134	NC_009033	TCTAT	2	10	5470	5479	20 %	60 %	0 %	20 %	126464921
135	NC_009033	GGA	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464921
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137	NC_009033	AT	3	6	5551	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	126464921
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